Fábián Gergely 2009-2013 között a Magyar Nemzeti Bank senior elemzője, 2013 és 2015 között főosztályvezetője, majd 2015-től 2017-ig igazgatója.
2017-től 2022-ig a Magyar Nemzeti Bank ügyvezető igazgatójaként dolgozik. Ezzel párhuzamosan a Budapest Institute of Banking Zrt. vezérigazgatói, valamint 2021-2022 között az MNB-EduLab Kft. ügyvezetői feladatait is ellátja.
2022 decemberétől a Gazdaságfejlesztési miniszter munkáját segíti iparpolitikáért és technológiáért felelős államtitkárként.